MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 60100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	386045635
2	NC_017545	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
3	NC_017545	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
4	NC_017545	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
5	NC_017545	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
6	NC_017545	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
7	NC_017545	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045635
8	NC_017545	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045635
9	NC_017545	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
10	NC_017545	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
11	NC_017545	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
12	NC_017545	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
13	NC_017545	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	386045635
14	NC_017545	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
15	NC_017545	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
16	NC_017545	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	386045635
17	NC_017545	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
18	NC_017545	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
19	NC_017545	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	386045635
20	NC_017545	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045635
21	NC_017545	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
22	NC_017545	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
23	NC_017545	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045635
24	NC_017545	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
25	NC_017545	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045635
26	NC_017545	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
27	NC_017545	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
28	NC_017545	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	386045635
29	NC_017545	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
30	NC_017545	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
31	NC_017545	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	386045635
32	NC_017545	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	386045635
33	NC_017545	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
34	NC_017545	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045635
35	NC_017545	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
36	NC_017545	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
37	NC_017545	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045635
38	NC_017545	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
39	NC_017545	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
40	NC_017545	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
41	NC_017545	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
42	NC_017545	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045636
43	NC_017545	TCG	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045636
44	NC_017545	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045636
45	NC_017545	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	386045636
46	NC_017545	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045636
47	NC_017545	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	386045636
48	NC_017545	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	386045636
49	NC_017545	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
50	NC_017545	ACA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
51	NC_017545	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	386045636
52	NC_017545	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
53	NC_017545	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	386045636
54	NC_017545	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045636
55	NC_017545	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045636
56	NC_017545	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045636
57	NC_017545	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045636
58	NC_017545	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045636
59	NC_017545	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
60	NC_017545	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
61	NC_017545	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
62	NC_017545	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045637
63	NC_017545	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
64	NC_017545	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
65	NC_017545	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
66	NC_017545	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045637
67	NC_017545	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
68	NC_017545	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
69	NC_017545	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045637
70	NC_017545	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
71	NC_017545	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
72	NC_017545	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045637
73	NC_017545	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
74	NC_017545	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045637
75	NC_017545	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045637
76	NC_017545	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
77	NC_017545	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
78	NC_017545	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
79	NC_017545	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045637
80	NC_017545	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045637
81	NC_017545	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045637
82	NC_017545	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045637
83	NC_017545	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045637
84	NC_017545	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
85	NC_017545	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
86	NC_017545	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	386045637
87	NC_017545	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
88	NC_017545	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	386045637
89	NC_017545	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045637
90	NC_017545	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	386045637
91	NC_017545	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045637
92	NC_017545	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045638
93	NC_017545	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	386045638
94	NC_017545	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	386045638
95	NC_017545	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045638
96	NC_017545	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	386045639
97	NC_017545	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	386045639
98	NC_017545	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045639
99	NC_017545	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045639
100	NC_017545	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	386045639
101	NC_017545	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
102	NC_017545	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	386045639
103	NC_017545	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045639
104	NC_017545	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045639
105	NC_017545	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	386045639
106	NC_017545	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	386045639
107	NC_017545	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045639
108	NC_017545	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045639
109	NC_017545	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045639
110	NC_017545	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045639
111	NC_017545	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045639
112	NC_017545	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045639
113	NC_017545	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
114	NC_017545	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
115	NC_017545	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	386045639
116	NC_017545	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
117	NC_017545	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045640
118	NC_017545	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
119	NC_017545	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386045640
120	NC_017545	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	386045640
121	NC_017545	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045640
122	NC_017545	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045640
123	NC_017545	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045640
124	NC_017545	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045640
125	NC_017545	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
126	NC_017545	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
127	NC_017545	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045640
128	NC_017545	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386045640
129	NC_017545	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
130	NC_017545	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	386045640
131	NC_017545	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045640
132	NC_017545	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	386045640
133	NC_017545	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
134	NC_017545	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045640
135	NC_017545	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045640
136	NC_017545	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045640
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256	NC_017545	TGA	2	6	12692	12697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045643
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258	NC_017545	AGT	2	6	13013	13018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045644
259	NC_017545	TTC	2	6	13055	13060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045644
260	NC_017545	T	7	7	13065	13071	0 %	100 %	0 %	0 %	386045644
261	NC_017545	GAT	2	6	13083	13088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045644
262	NC_017545	TGC	2	6	13214	13219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045644
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264	NC_017545	TA	3	6	13246	13251	50 %	50 %	0 %	0 %	386045644
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